安徽中医药大学创建于1959年、其前身为1952年创立的安徽省中医进修班。1959年、安徽省政府正式批准成立安徽中医学院。1970年、安徽中医学院并入安徽医学院。1975年、国家教育部批准恢复安徽中医学院。2000年、安徽省医药学校并入安徽中医学院。2011年、省政府批准在安徽中医学院的基础上组建成立安徽省中医药科学院。2013年、教育部同意安徽中医学院更名为安徽中医药大学。

安徽中医药大学创建于1959年、其前身为1952年创立的安徽省中医进修班（学校）。