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中国科学院大学重庆医院、重庆市人民医院、重庆市心肺血管疾病医疗研究所、重庆市老年病防治研究所、重庆市骨伤骨病医疗中心、重庆市临床检验中心、重庆市眼耳鼻咽喉科医院；重庆市心血管外科学临床医学研究中心、重庆市医学检验学临床医学研究中心；国家临床重点专科建设项目过敏反应科；拥有国家发改委血管植入物工程实验室、市级重点实验室神经变性病实验室、市级医学重点实验室肾脏病透析治疗研究室、临床检验质量控制研究室、重庆市唯一的结核基因诊断中心实验室。