动物科技学院是石河子大学历史较为悠久的学院之一、前身为1959年成立的中国人民解放军新疆军区生产建设兵团农学院畜牧兽医系。1994年更名为石河子农学院动物科学系、2001年成立石河子大学动物科技学院。